Page 11 - MaSzeSz hírcsatorna 2020/4.

SZAKMAI - TUDOMÁNYOS ROVAT

sorolják és eredményeiket honlapjukon teszik A különböző helyekről és időpontokból szár-
közzé. A heti rendszerességgel végzett vizs- mazó SARS-CoV-2 genomokat a kutatók fo-
gálatok és az ezek alapján végzett rövid távú lyamatosan szekvenálják. 2020.10. 29-ig a GI-
előrejelzések (4-10 nap) segítik a járványügyi in- SAID nevű adatbázisban több mint 167 000
tézkedések tervezését. Magyarország jelenleg darab genom gyűlt össze. [8] A genomokat
az Egészségügyi Világszervezet (WHO) Európai hasonlóságaik alapján csoportosíthatjuk tör-
régiójában azon kevés országok egyike, ahol zsekbe vagy kládokba. A vírusok és baktériu-
ezek a vizsgálatok a járványügyi intézkedések mok esetében új törzsnek egy olyan változatot
kapcsán érdemben hasznosulnak, és a lakos- tekintünk, mely esetében megváltozik a kór-
ság rendszeres tájékoztatása útján a megelő- okozó és a gazdaszervezet közötti kapcsolat.
zést szolgálják. [5] [7] A klád kifejezést inkább olyan genetikai vál-
A SARS-CoV-2 a Nemzetközi Vírus Taxonó- tozások esetén használjuk, melyek a vírus fer-
miai Bizottság (ICTV) szerint a SARS-t okozó tőzőképességét nem befolyásolják. [9]
koronavírusok (SevereAcuteRespiratorySynd- A Nextstrain programot fejlesztő kutatócso-
rome-relatedvirus) közé tartozik. [6] A faj töb- port a GISAID adatbázisban található szek-
bi tagjához hasonlóan hordoz bizonyos fajra venált vírus genomok földrajzi eredete és
jellemző szekvenciákat, de genomja olyan szekvenálás időpontja alapján interaktív le-
egyedi szekvenciákat is tartalmaz, melyek a faj származási (filogenetikai) fát és terjedési térké-

többi tagjának genomjában nincsenek jelen. pet készít, lehetővé téve a vírus evolúciójának
A SARS-CoV-2,genomjában található ismert és sokféleségének (diverzitásának) követését.
egyedi szekvenciái alapján különíthető el a faj A Nextstrain alapján a SARS-CoV-2 jelenleg
többi tagjától például PCR módszerekkel. hét kládba sorolható: S, L, O, V, G, GH, GR.
Egy vírusfertőzés során a gazdaszervezetbe [10]
jutó vírus arra kényszeríti a gazdaszervezet
sejtjeit, hogy róla másolatokat készítsenek, A VEO kutatói egy nem régiben megjelent
kezdve a vírus genomjával. A másolás nem tanulmányban holland és belga szennyvíz
mindig tökéletes, ezért a vírus genomjának mintákban vizsgálták a SARS-CoV-2 gen-
másolata már nem mindig lesz teljesen azo- omok diverzitását, majd az eredményeket
nos az eredeti genommal, kisebb hibák, mu- összehasonlították a páciensekből vett vírus
tációk lehetnek benne, amik tovább öröklőd- szekvenciák diverzitásával. A szennyvíz előnye
nek a másolatok másolataiba és potenciálisan az emberekből származó mintákhoz képest,
újabbakkal egészülnek ki. Hogy a vírus gen- hogy a mintagyűjtés egyszerűbb, a minták
omban hol és milyen gyakorisággal jelennek nem csak a tünetekkel rendelkező pácien-
meg ezek a mutációk, az számos tényezőtől sekből származnak és viszonylag kis számú
függ. Például az RNS-vírusok genomja gyor- minta is elegendő, hogy a vírus időbeli vál-
sabban mutálódik, mint a DNS-vírusoké. [7] tozásáról és diverzitásáról információt nyer-
A mutáció eredményeként újabb és újabb ví- jünk. Nehézséget jelent, hogy a szennyvíz
rus „típusok”, SARS-CoV-2 változatok jönnek kémiailag és biológiailag is komplex közeg.
létre, melyeket genom szekvenciájuk ismere- A vírus örökítőanyagának koncentrációja ala-
tében lehet hatékonyan azonosítani. csony, ami nehezíti a teljes vírus genomok

11